Hvorfor skærer de fleste restriktionsenzym ved palindromisk sekvens?

Hvorfor skærer de fleste restriktionsenzym ved palindromisk sekvens?
Anonim

Svar:

Fordi det er mere effektivt.

Forklaring:

Enzymer som restriktionsenzymer skal genkende en meget specifik sekvens for at udføre sin opgave. Det binder kun til DNA'et i en bestemt konfiguration. Heldigvis! fordi du ikke vil have en 'pacman', der skærer DNA til tilfældige steder.

DNA er dobbeltstrenget, så det har 'to sider', som enzymet kan binde til. En palindromisk sekvens er den samme bagud og fremad på begge sider (se billedet nedenfor). Dette betyder, at enzymet genkender sekvensen, uanset hvilken side enzymet nærmer sig DNA'et.

En palindromisk sekvens øger også chancen for, at begge DNA-tråde skæres. Det er endda muligt, at to enzymer virker som en dimer for at skære den palindromiske sekvens, hvilket yderligere øger effektiviteten.

Den sidste årsag har været vigtig i kampen mellem vira og bakterier. Bakterier har udviklet sig til at deaktivere bakterieorienterende vira (bakteriofager) ved hjælp af restriktionsenzymer, der binder til disse palindromiske sekvenser. At skære begge strenge af DNA beskadiger viruset mere end at skære en streng.